La plante aurait été découverte il y a 5 000 ans dans ce qui est aujourd’hui l’Afghanistan. En Europe on cultive la carotte dès le XVIII^e siècle. À cette époque, on connaît des variétés à chair ou à peau blanche, jaune, rouge, verte, marron et noire, mais pas de carottes orange.

En fait, la carotte orange est le produit d’une intervention humaine. Ce sont des Hollandais qui croiseront au XVI^e siècle des variétés à chair rouge et à chair blanche et finiront par obtenir une racine d’un bel orange lumineux. C’est en gage de fidélité qu’ils offrirent au Prince d’Orange (de la maison Orange famille régnante en Hollande) cette carotte plus « gouteuse » et moins filandreuse que ces ancêtres. Cette espèce a donc pris place sur la table du Prince avant de s’exporter dans les autres pays du monde.